Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppef2O35385 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms