Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh2d1bO35324 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d1bO35324 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms