Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hs3st1O35310 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms