Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Polr1aO35134 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms