Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GclmO09172 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GclmO09172 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GclmO09172 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GclmO09172 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GclmO09172 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GclmO09172 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GclmO09172 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GclmO09172 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GclmO09172 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GclmO09172 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GclmO09172 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms