Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
WrnO09053 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WrnO09053 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WrnO09053 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WrnO09053 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WrnO09053 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WrnO09053 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WrnO09053 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WrnO09053 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
WrnO09053 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WrnO09053 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WrnO09053 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WrnO09053 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WrnO09053 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WrnO09053 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WrnO09053 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WrnO09053 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WrnO09053 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WrnO09053 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WrnO09053 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WrnO09053 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WrnO09053 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WrnO09053 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WrnO09053 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WrnO09053 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WrnO09053 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WrnO09053 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WrnO09053 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WrnO09053 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms