Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NumblO08919 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NumblO08919 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NumblO08919 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NumblO08919 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NumblO08919 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms