Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MttpO08601 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MttpO08601 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MttpO08601 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MttpO08601 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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MttpO08601 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MttpO08601 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MttpO08601 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MttpO08601 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MttpO08601 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MttpO08601 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MttpO08601 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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