Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8050L7N2E3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms