Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms