Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim34bJ3QNR8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim34bJ3QNR8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms