Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim18J3QNP2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim18J3QNP2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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