Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm21788J3QNH3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21788J3QNH3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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