Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms