Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21719J3KMI9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms