Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20828J3KMI7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20828J3KMI7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms