Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms