Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf4bG5E8Z2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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