Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc4lG5E8X2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms