Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4933406M09RikG3XA12 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms