Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcf11G3X9Z4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms