Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms