Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgef1G3X9K3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms