Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan2G3X952 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms