Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r167G3UW71 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r167G3UW71 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms