Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms