Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScaperF8VQ70 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms