Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Colca2F8VPY8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Colca2F8VPY8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Colca2F8VPY8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms