Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M1F7CXU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms