Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm28038F7BCN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm28038F7BCN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm28038F7BCN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28038F7BCN9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28038F7BCN9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28038F7BCN9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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