Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
D430041D05RikF6ZGR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms