Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms