Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Crocc2F6XLV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms