Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17093F6XGJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms