Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zfp988F6VKC7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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