Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms