Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms