Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc141E9Q8Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms