Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Usp31E9Q6Y8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp31E9Q6Y8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp31E9Q6Y8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp31E9Q6Y8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms