Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf11E9Q6E5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms