Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms