Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms