Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms