Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms