Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip11E9Q512 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms