Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde8bE9Q4S1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms