Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pgbd1E9Q492 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pgbd1E9Q492 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms