Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp558E9Q1J0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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