Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt78E9Q0F0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms