Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfta2E9PXB6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfta2E9PXB6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms